京八流の宗家・吉岡清十郎（江原真二郎）と対決した宮本武蔵（中村錦之助）。その勝敗は武蔵の一撃で決まった。だが、戦いはこれで終わりではなかった。吉岡一門は、その名誉にかけて武蔵を討ち果たす覚悟を固める。弟の伝七郎（平幹二朗）が一門を率いて、ついに武蔵の行方を探し当てるが、大勢の門弟で武蔵を取り囲んだとき、佐々木小次郎（高倉健）が現れる。そして改めて武蔵と吉岡一門の決闘の日取りが決められた。日時は明後日の寅の下刻、場所は叡山道、一乗寺下り松の所。そして約束の日、吉岡一門は総勢七十三名をもって、武蔵を待ち受けていた……。

武者修行の旅に出た宮本武蔵（中村錦之助）は、再会したお通（入江若葉）の同行の願いを振り切り、旅を続ける。武蔵は、ある村で父を亡くしたばかりの少年・伊織（金子吉延）と出会う。埋葬を手伝った武蔵は、ひとりぼっちになった伊織と同居し、共に荒れ地を耕し、秋になると二俵の米を収穫する。村は米を狙う野武士の集団に襲われるが、武蔵はこれを撃退し、伊織を連れて江戸へ向かう。江戸で刀を研ぎに出した武蔵は、その店で佐々木小次郎（高倉健）の刀を見つけ、後日店を訪れた小次郎もまた武蔵の刀を見つけ、互いに江戸にいることを知る。